南京的本科大學有南京大學、東南大學、南京航空航天大學、南京理工大學、南京工業(yè)大學等;南京的專科大學有南京工業(yè)職業(yè)技術學院、江蘇經貿職業(yè)技術學院、江蘇聯(lián)合職業(yè)技術學院等。
| 學校名稱 | 學校標識碼 | 主管部門 | 所在地 | 辦學層次 | 備注 | 
| 南京大學 | 4132010284 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 東南大學 | 4132010286 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京航空航天大學 | 4132010287 | 工業(yè)和信息化部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京理工大學 | 4132010288 | 工業(yè)和信息化部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京工業(yè)大學 | 4132010291 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京郵電大學 | 4132010293 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 河海大學 | 4132010294 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京林業(yè)大學 | 4132010298 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京信息工程大學 | 4132010300 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京農業(yè)大學 | 4132010307 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京醫(yī)科大學 | 4132010312 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京中醫(yī)藥大學 | 4132010315 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 中國藥科大學 | 4132010316 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 南京師范大學 | 4132010319 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京財經大學 | 4132010327 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 江蘇警官學院 | 4132010329 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京體育學院 | 4132010330 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京藝術學院 | 4132010331 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 三江學院 | 4132011122 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京工程學院 | 4132011276 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京審計大學 | 4132011287 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京曉莊學院 | 4132011460 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京特殊教育師范學院 | 4132012048 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京森林警察學院 | 4132012213 | 國家林業(yè)局 | 南京市 | 本科 | |
| 東南大學成賢學院 | 4132012689 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 金陵科技學院 | 4132013573 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京大學金陵學院 | 4132013646 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京理工大學紫金學院 | 4132013654 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京航空航天大學金城學院 | 4132013655 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 中國傳媒大學南廣學院 | 4132013687 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京工業(yè)大學浦江學院 | 4132013905 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京師范大學中北學院 | 4132013906 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京信息工程大學濱江學院 | 4132013982 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 南京審計大學金審學院 | 4132013994 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 | 
| 江蘇第二師范學院 | 4132014436 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 
| 學校名稱 | 學校標識碼 | 主管部門 | 所在地 | 辦學層次 | 備注 | 
| 南京工業(yè)職業(yè)技術學院 | 4132010850 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 江蘇經貿職業(yè)技術學院 | 4132012047 | 江蘇省 | 南京市 | 專科 | |
| 江蘇聯(lián)合職業(yè)技術學院 | 4132012678 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 江蘇海事職業(yè)技術學院 | 4132012679 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 應天職業(yè)技術學院 | 4132012680 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 專科 | 民辦 | 
| 南京交通職業(yè)技術學院 | 4132012804 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京科技職業(yè)學院 | 4132012920 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 正德職業(yè)技術學院 | 4132012921 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | ? | 民辦 | 
| 鐘山職業(yè)技術學院 | 4132012922 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 專科 | 民辦 | 
| 金肯職業(yè)技術學院 | 4132013100 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | ? | 民辦 | 
| 南京鐵道職業(yè)技術學院 | 4132013106 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京信息職業(yè)技術學院 | 4132013112 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京視覺藝術職業(yè)學院 | 4132013964 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | ? | 民辦 | 
| 江蘇城市職業(yè)學院 | 4132014000 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京城市職業(yè)學院 | 4132014001 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京機電職業(yè)技術學院 | 4132014056 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 南京旅游職業(yè)學院 | 4132014180 | 江蘇省 | 南京市 | ? | |
| 江蘇衛(wèi)生健康職業(yè)學院 | 4132014255 | 江蘇省 | 南京市 | ? | 
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